目前在上，很多重要的疾病診斷標志物均使用酶聯免疫測定方法來檢測，如抗HAV IgM，乙肝“兩對半"、抗HCV，抗HIV，ELISA試劑盒梅毒抗體、優生優育TORCH系列、性病病原體的抗原或抗體等傳染性病原體血清標志物、激素、腫瘤標志物、自身抗體、特種蛋白、細胞因子和治療藥物以及HBVDNA，HCV-RNA，遺傳病基因、腫瘤基因、基因突變等，這些標志物直接關系到患者的診斷和治療。從理論上說，一種生物或生理活性物質，只要有辦法得到其特異的抗體，就可以建立這種物質的酶聯免疫測定方法。
在以前看來一些難以進行質量測定的微量生物活性物質。ELISA試劑盒的測定方法是以抗原抗體間的特異反應為基礎的，其與生化的化學反應有著本質的區別，并且由于標記物如同位素、酶、熒光素、微量元素、發光物質等的摻人，酶聯免疫測定技術從低靈敏的免疫沉淀和免疫凝集反應進入到了高靈敏的放射免疫、酶免疫、熒光免疫和發光免疫測定時代，可見酶聯免疫測定更多的是用于生物活性物質的微量測定。
而在血站，HBsAg，抗HCV，抗HIV和梅毒抗體等標志物的檢測，哪怕是1％的錯誤，對將要接受輸血的特定患者來說，ELISA試劑盒就是100％的災難。近期，在電視、報紙等新聞媒體中，常可見到一些有關醫患糾紛的報道，其中一些就與酶聯免疫測定有關，如輸血后丙肝病毒、艾滋病毒感染的發生，性病檢測的假陽性等。
